1、水性涂料對施工過程中及材質表面清潔度要求高，因水的表面張力大，污物易使涂膜產生縮孔;
　　2、水性涂料對抗強機械作用力的分散穩定性差，輸送管道內的流速急劇變化時，分散微粒被壓縮成固態微粒，使涂膜產生麻點。要求輸送管道形狀良好，管壁無缺陷。
　　3、水性涂料對涂裝設備腐蝕性大，需采用防腐蝕襯里或不銹鋼材料，設備造價高。水性涂料對輸送管道的腐蝕，金屬溶解，使分散微粒析出，涂膜產生麻點，也需采用不銹鋼管。
　　4、烘烤型水性涂料對施工環境條件(溫度、濕度)要求較嚴格，增加了調溫調濕設備的投入，同時也增大了能耗。
　　5、水的蒸發潛熱大，烘烤能量消耗大。陰極電泳涂料需在180℃烘烤；而乳膠涂料完全干透的時間則很長。
　　6、沸點高的有機助溶劑等在烘烤時產生很多油煙，凝結后滴于涂膜表面影響外觀。